Так тут косяк в том, что профи с такими видео вообще не работают. По крайней мере с большим количеством в одном проекте. Перекод по сути одно из решений. Вот только вопрос, насколько хандбрейк справится с этой задачей. Если нужно проф решение, то можно попробовать пересчитать в нужный fps при помощи твикстор. Будет очень долго! Ну или применить премьеровский оптикал флау. Только вот он появился в версии 2014, если не ошибаюсь